这门课程首先介绍了环境中的主要微生物的类群、个体形态、结构、微生物的生理代谢、生长繁殖规律，使大家对环境微生物有个初步了解。然后重点描述栖息在水体、土壤、空气、城市生活污水、工业废水和城市有机固体废物生物处理，以及废气生物处理中的微生物及其生态、微生物对自然环境物质的转化、水体和土壤的自净、污废水、废气和有机固体废弃物的生物净化微生物原理。 通过这门课程的学习，可以让学生掌握环境中存在的主要和常见微生物、环境污染与自净微生物的内在联系、微生物队环境物质包括污染物质的转化、污染物净化设施中微生物的作用、环境微生物的检验和调控手段等。 相对工程类课程，本门课程内容生动、有趣、感性。 本课程共12章24节内容，每周2学时，计12周内完成。主要讲述内容包括：绪论、原核微生物、真核微生物、病毒、微生物的营养、微生物的代谢、微生物的生长繁殖及其控制、微生物生态、微生物在物质循环中的作用、污（废）水生物处理微生物、污（废）水脱氮除磷微生物、水中有害微生物的控制。
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